Anwendungsbezogene Bioinformatik und Biostatistik - auf Englisch

Bioinformatik wird in Berlin-Brandenburg groß geschrieben! In dieser Weiterbildung werden Ihnen Kompetenzen der Bioinformatik und Biostatistik als Schnittstellenwissenschaft von Biologie und Informatik vermittelt. Hierzu gehören Grundlagen im Umgang mit Shell und LINUX sowie Auswertungsmethoden der Bioinformatik, wie z. B. Sequenzanalyse, Next Generation Sequencing (NGS), Visualisierung von Strukturen. Außderdem erlernen Sie die zielgerichtete Nutzung (molekular-)biologischer Datenbanken, die Anwendung statistischer Verfahren einschließlich des statistischen Auswertungsprogrammes R sowie das Schreiben kleinerer Auswertungsskripte mit der Programmiersprache Python. Mit dem Abschluss der Weiterbildung sind Sie in der Lage, gemeinsam mit Experten*innen aus Naturwissenschaften, Mathematik und Informatik Lösungen für naturwissenschaftliche Problemstellungen zu entwickeln. Ein Praktikum in einem Unternehmen oder Institut verbessert Ihre beruflichen Perspektiven und Beschäftigungsmöglichkeiten.

Inhalte der Weiterbildung:

1. Einführung in Programmierung und Python

Bewerbungsstrategien, Berufsbild und -perspektiven

Einführung in Linux und Bash (Bourne-again shell) unter Linux

Grundlagen der Programmierung (Programmiermethodik, Pseudocode, Datenstrukturen)

Versionskontrolle und Dokumentation von Code (Git/GitHub)

Einführung in die Programmiersprache Python

Objektorientierte Programmierung in Python

2. Bioinformatik und Biodatenbanken

NCBI- und Interaktionsdatenbanken

Biopython: Web Services

Datenbankmanagement

Relationales Datenbankschema, SQL-Anbindung

3. Anwendungsbezogene Bioinformatik

Sequenzanalyse, Sequenzierstrategien

Paarweise und multiple Alignments, BLAST-Varianten

Strukturbioinformatik, Software zur Visualisierung von Strukturen

Automatisierte Bilderkennungsverfahren. Digitale Bildverarbeitung. Beispiel: Automatische Zellen- und Flächenberechnung

4. Anwendungsbezogene Biostatistik

Grundlagen der Statistik, deskriptive und multivariate Statistik

Statistische Auswertungen mit R / R-Studio

Varianz-, Hauptkomponenten-, Cluster- und Diskriminantenanalyse

Konzepte des Machine Learning (Markov-Ketten-Implementierung)

Künstliche neuronale Netze / Netzwerke

Einsatz von künstlicher Intelligenz (KI), insbesondere von Programmen wie ChatGPT

5. Next Generation Sequencing

Einführung in NGS. Grundlagen von NGS

Kennenlernen von NGS-Datenformaten (FASTQ, SAM/BAM)

Installation von NGS Programmen/Tools

Verarbeitung von Sequenzierdaten (Qualitätskontrolle, Trimming, Mapping)

Anwendung von Conda zur Erstellung und Verwaltung von Softwareumgebungen für die NGS-Datenanalyse

Erstellen von NGS-Workflows (Galaxy und Snakemake oder R und Nextflow)

6. Praktikum

Gemeinsame Organisation einer Projektphase in einem Unternehmen / Institut

Individuelles Bewerbungscoaching

Abgleich von selbständig erstellter Unternehmens-Liste mit dem CQ-Unternehmens-Netzwerk zur besseren Koordination

Bereitstellung von Recherchehilfsmitteln (Plattformen, Verbände, Vereine, Technologieparks, Stellenanzeigen)

Möglichkeit zur Anwendung des Erlernten in einem Arbeitsprozess mit realen Daten

Für Teilnehmende, die nicht in Berlin wohnen, kann das Praktikum gerne im Umkreis des jeweiligen Wohnsitzes oder remote absolviert werden

Die Tür zu einer Arbeitsstelle

Unterstützung beim Bewerbungsprozess

Recherchierte Stellenanzeigen (deutschlandweit) werden zur Verfügung gestellt

Bis 6 Monate nach Beendigung der Weiterbildung werden die recherchierten Stellenanzeigen per E-Mail an die ehemaligen Teilnehmenden gesendet.

Für Arbeitsuchende ist die Finanzierung mit Bildungsgutschein der Agentur für Arbeit und der Jobcenter möglich. 

Die Weiterbildung wird online (live) bzw. in Präsenz durchgeführt.

Bei Fragen beraten wir Sie gerne - sprechen Sie uns einfach an.